虽然目的一样，但两者还是存在本质上的区别，国家助学金和贫困生补助的区别如下：
1.两者的资金水平不同：国家补助金的数量由财政部决定。主要资助贫困家庭学生的生活费。申请人需符合基本条件，并向学校提交国家助学金申请表。贫困生资助是一个逐步下降的过程，分省、市、县三级进行筛选。
2.两者的考核过程不同：国家助学金由中央和地方国家共同出资，用于资助家庭经济困难的全日制普通大学生(含高职、二本学士)。贫困生资助由国家下拨到所在省，再从省级下拨。它需要一个审查过程。在不同的城市，上学的时间是不同的。
3.申请文件上的印章不同：国家助学金的印章不超过3枚，而是学校的印章。贫困证明必须加盖村级、镇、县三级国家民政部门公章，经学校批准后方可领取补助。
4.两种资助标准不同：国家助学金平均补助标准为每生每年3000元，具体标准确定在每生每年1500-4000元的范围内，分为2-3个档次。中央高校国家助学金的分类和具体标准，由财政部会同有关部门确定，地方高校国家助学金的分类和具体标准由省(自治区、直辖市)确定。贫困生平均资助标准为每生每年2000元，具体标准确定在每生每年1000-3000元的范围内，分为2-3个档次。
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